Высокогорский мужской монастырь был основан в 1716 году по решению арзамасских купцов и мещан. Они написали челобитную царю Петру Алексеевичу, в которой просили разрешения и давали обет построить на Высокой горе, в лесу, часовню, а при ней две кельи для монахов.
В декабре 1719 года по ходатайству набожных арзамасцев началось строительство теплой деревянной церкви в честь иконы Божией Матери Тихвинская. В 30-х годах XVIII века основанный монастырь несколько раз подвергался нападению разбойников, которые обитали в непроходимых арзамасских лесах. Иноки все монастырское имущество перенесли в Арзамасский Троицкий монастырь. Обитель опустела, а вскоре и вовсе была разрушена.
В 1743 году по распоряжению Синода после ходатайства жителей Арзамаса монастырь был возобновлен, но на самой вершине горы, в глубине леса. В 1745 году здесь была сооружена теплая трехпрестольная каменная Вознесенская церковь с приделами в честь иконы Божьей Матери «Всех скорбящих Радость» и благоверных князя Петра и княгини Февронии Муромских. Монастырь был назван Высокогорской пустошью, а по главному престолу храма – Вознесенской.
С 1779 года Высокогорская пустынь числилась приписной к Саровской. У монастыря появились собственные благотворители: князья, помещики, купцы. Благоволил монастырю и Новгородский митрополит Димитрий (Сеченов) и его отец Алексей Иванович.
В 1784 году монастырь был обнесен со всех сторон каменными стенами с башнями, в следующем году над святыми воротами начали строить каменную колокольню, которая существовала до советских времен.
К началу ХХ века в монастыре было три церкви: соборная холодная в честь Вознесения Господня, теплая каменная церковь в честь Покрова Пресвятой Богородицы с усыпальницей, домовая во имя святителя и чудотворца Тихона Задонского. Над святыми створчатыми вратами высилась четырехъярусная колокольня с 10 колоколами.
Ежегодно в праздник Вознесения из Арзамаса устраивался крестный ход. К этому времени в обитель стекались целые толпы богомольцев. В 1904 году в обители проживали 10 монахов и 40 послушников. В монастыре пребывали чудотворные иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость» и «Иверская».
В 1921 году постановлением Арзамасского уездного исполкома обитель была ликвидирована. Сначала здесь были организованы курсы для командиров и бойцов Красной армии, а в 1948 году – детская трудовая колония.
Решение о возрождении древней святыни Арзамаса было принято после возвращения Нижегородской епархии здания действующего храма в честь Покрова Пресвятой Богородицы, сохранившегося с монастырских времен. До своего расформирования воспитательная колония тесно сотрудничала с Арзамасским благочинием, в том числе со Свято-Николаевским монастырем. Сестры общались с воспитанниками, занимались с ними хоровым пением, вели занятия в воскресной школе. Каждую субботу в Покровском храме совершалась литургия.
8 апреля 2021 года митрополит Нижегородский и Арзамасский Георгий посетил город Арзамас. В рамках архипастырского визита правящий архиерей побывал в Высокогорском мужском монастыре. В Покровском храме митрополит Георгий совершил молебен на начало благого дела. По благословению митрополита Георгия настоятелем архиерейского подворья Высокогорского Вознесенского мужского монастыря и ответственным за возрождение обители назначен настоятель Вознесенского Печерского монастыря Нижнего Новгорода архимандрит Тихон (Затёкин).
Кроме Покровского собора, на территории бывшей колонии сохранились четыре монастырских строения: архимандритский корпус, в котором находился штрафной изолятор, и три братских корпуса. Стены, башни монастыря, а также колокольня и Вознесенский собор были снесены.
В настоящее время в Покровском храме проведены внутренние работы: оштукатурены и подготовлены под роспись стены, залит пол, сооружен временный иконостас. Проведены наружные работам: на кровлю храма установлены барабан и купол. Иеромонахи из Нижегородского Вознесенского Печерского монастыря регулярно совершают Божественные литургии.
В августе 2024 года в Министерстве юстиции России под председательством заместителя министра Всеволода Вуколова состоялось рабочее совещание, посвященное передаче Нижегородской епархии комплекса зданий, расположенных на территории бывшего Высокогорского мужского монастыря и находящихся в оперативном управлении Главного управления Федеральной службы исполнения наказаний (ГУ ФСИН) России по Нижегородской области.
Покровский храм, расположенный на территории бывшего Высокогорского мужского монастыря, возвращен Церкви.
При этом часть монастырских построек находится в оперативном подчинении региональной уголовно-исполнительной системы, в части зданий размещается помещения исправительной колонии №20 ГУ ФСИН России по Нижегородской области, где отбывают наказание осужденные к принудительным работам.
Итогом совещания стало решение о передаче монастырских зданий в ведение Нижегородской епархии. Здания, занимаемые колонией, будут переданы Церкви после определения альтернативного варианта размещения исправительного учреждения и его передислокации.
16 ноября 2024 года на территории возрождающегося Высокогорского Вознесенского мужского монастыря Арзамаса митрополит Нижегородский и Арзамасский Георгий освятил крест для восстанавливаемого храма в честь Покрова Пресвятой Богородицы.
