Архиепископ Нектарий родился 11 декабря (30 ноября) 1819 года в городе Моршанске Тамбовской губернии, в семье диакона Самуила Ивановича Надеждина, и в крещении наречен был Николаем. Окончив в 1839 году курс обучения в Тамбовской духовной семинарии, поступил в Киевскую духовную академию и, будучи еще студентом, 22 октября 1842 года пострижен в монашество с наречением имени Нектарий.
25 декабря того же года рукоположен в иеродиаконы. 14 августа 1843 года, по окончании академического курса, рукоположен в иеромонахи и в том же году (31 октября) определен смотрителем Приворотских уездного и приходского училищ и учителем высшего отделения.
С 22 апреля 1849 года Нектарий — инспектор Киевской духовной семинарии, профессор богословия. За ревностное служение в должности эконома митрополитского дома ему изъявлена архипастырская признательность.
19 ноября 1850 года Нектарий возведен в сан архимандрита.
В 1856 году Нектарий перемещен в Новгородскую духовную семинарию — ректором и профессором богословских наук, а также настоятелем второклассного Антониева монастыря. 5 сентября 1859 года Нектарий наречен, а 13-го хиротонисан в епископа Выборгского, викария Санкт-Петербургской епархии.
На Нижегородскую кафедру Преосвященный Нектарий был утвержден 29 сентября 1860 года: Всемилостивейше повелено ему быть епископом Нижегородским и Арзамасским. При прощании со студентами Санкт-Петербургской академии и отъезде в Нижегородскую епархию ему на память поднесена была воспитанниками, из собственных их скромных средств, драгоценная панагия.
26 октября 1860 года, со вступлением в управление Нижегородской епархией, Преосвященный принял на себя обязанность Почетного члена Нижегородского попечительства о детских приютах.
В течение девяти лет Преосвященный Нектарий служил во благо Нижегородской епархии. 7 сентября 1864 года за пастырскую заботливость об увеличении свечного дохода объявлена ему признательность Святейшего Синода.
4 апреля 1865 года он удостоен ордена святой Анны I степени «За усердное и полезное Церкви служение, одушевленное ревностью к духовному просвещению и к благоустроению епархии». В июле того же года, по Высочайшему повелению, Преосвященный вызван в Санкт-Петербург для присутствия в Святейшем Синоде, где и находился до середины 1869 года.
14 мая 1867 года Преосвященный Нектарий, епископ Нижегородский и Арзамасский, возведен в сан архиепископа именным Высочайшим указом «за отлично-усердное служение, пастырскую попечительность о благоустройстве епархии и состоящих в ней духовно-учебных учреждений, преимущественно же за понесенные труды при составлении проектов устава духовных семинарий и училищ».
21 января 1869 года Высокопреосвященный Нектарий утвержден архиепископом Харьковским и Ахтырским, на Харьковскую кафедру прибыл 21 июня.
7 сентября 1873 года владыка Нектарий почувствовал серьезное ухудшение состояния здоровья и подписал краткое духовное завещание. Владыка Нектарий скончался на 54-м году жизни, 12 сентября 1873 года был отпет по чиноположению и погребен в архиерейской усыпальнице Покровского монастыря.
При цитировании ссылка (гиперссылка) на сайт Нижегородской епархии обязательна.